ในฤดูกาลที่แล้วมีสโมสรที่ตกชั้นจำนวน 4 สโมสร (จากปกติ 2 สโมสร) เนื่องจากไม่มีสโมสรตกชั้นในฤดูกาล 2020 เนื่องจากผลของการระบาดทั่วของโควิด-19 ในประเทศญี่ปุ่น[2] ซึ่งทำให้จำนวนสโมสรในฤดูกาล 2021 เพิ่มเป็น 20 สโมสร[3] สโมสรที่ตกชั้นได้แก่โทกูชิมะ วอร์ติส, โออิตะ ทรินิตา, เวกัลตะ เซ็นได และโยโกฮามะ ในขณะที่สโมสรที่เลื่อนชั้นขึ้นมาได้แก่จูบิโล อิวาตะ สโมสรชนะเลิศจากเจลีก ดิวิชัน 2 ที่เลื่อนชั้นกลับขึ้นมาหลังจากตกชั้นไป 2 ฤดูกาล และเกียวโต ซังงะ สโมสรรองชนะเลิศดิวิชัน 2 ที่เลื่อนชั้นกลับขึ้นมาหลังจากตกชั้นไป 11 ฤดูกาล